经历了SARS的冲击，香港人民终于逐渐走出阴霾，恢复生活的正常。然而，对脑外科医师程至美（吴启华饰）而言，一条突如其来的消息令他的生活再次陷入低谷——旧爱去世的消息，使他情绪崩溃，心深感愧疚和抑郁。法医岑雅晴（黎姿饰）在此时给予程至美支持，鼓励他重新振作。另一方面，急诊科医师黎国柱（林保怡饰）在结束与女友的关系后，意外卷入三角恋，与骨科医生叶淘（吴美珩饰）和见习医生曾淑琪（廖碧儿饰）之间的情感纠葛。心脏科医生林敏智（陈豪饰）遭受SARS影响，虽有后遗症却选择隐瞒病情，以维护个人的职业声誉，结果使状况愈发恶化。同时，妇产科医生万安生（邵美琪饰）与急救科医生向众仁（曹永廉饰）计划共同生活，但因护士戴玉莹（姚嘉妮饰）的介入，感情受到考验。《妙手仁心3》为无线电视制播的一部现代医学题材电视剧，是“妙手仁心”系列治理的第三部。此次作品由监制戚其义与编剧周旭明的黄金搭档倾力呈现，继续秉持系列一贯的风格与理念，获取了医疗行业人员的支持与协助，通过实地拍摄方式，再次呈现出医护工作者在职业生涯中所面临的现实挑战及其不懈努力